[#] [Перевод] Высокопроизводительное сжатие DEFLATE с оптимизацией для геномных наборов данных
habrabot(difrex,1) — All
2015-05-07 12:00:03


![][1] igzip — высокопроизводительная библиотека для выполнения сжатия gzip или DEFLATE. Она была изначально описана в статье [Высокопроизводительное сжатие DEFLATE для процессоров с архитектурой Intel][2]. В этой статье описывается связанный [выпуск исходного кода][3], содержащий необязательные (во время сборки) оптимизации для повышения степени сжатия геномных наборов данных в форматах BAM и SAM. igzip работает примерно в 4 раза быстрее, чем Zlib при настройке на максимальную скорость, и с примерно такой же степенью сжатия для геномных данных. Мы считаем, что igzip можно схожим образом оптимизировать для других областей применения, где наборы данных отличаются от обычных текстовых данных. [Читать дальше →][4]

[1]: //habrastorage.org/files/acb/ce2/4d5/acbce24d5f8d46e3a395a41e5b569577.jpg
[2]: http://www.intel.com/content/www/us/en/intelligent-systems/wireless-infrastructure/ia-deflate-compression-paper.html
[3]: https://software.intel.com/sites/default/files/managed/2d/63/igzip_042.zip
[4]: http://habrahabr.ru/post/257273/#habracut